​카라와 L이 죽고 10년이 지난 후, 의문의 죽음이 세계 곳곳에서 발생한다. 일본 경시청은 사라진 데스노트와 관련이 있다고 믿고 특별수사 대책 본부를 세운다. 이때, 여섯 권의 데스노트를 노리는 정체불명의 해커가 나타나고 일본의 특별수사팀은 그를 잡기 위해 수사에 박차를 가한다.